现代药理知识持有者林远穿越至嘉靖年间，恰逢京师爆发瘟疫，崇文门一带尸横遍野、民不聊生。他凭借怀中《本草纲目》手抄残卷雏形，结合现代药理学，提取黄连、黄芩中的小檗碱，以提纯之法熬制汤药救人，虽初遇剂量失误，却成功挽回多名垂危者性命，包括濒死孩童。他的“怪法”迅速传开，百姓或奉其为“活菩萨”，或斥为“妖术”，更引来了权臣严嵩的忌惮，视其“通晓天机”为心腹大患，命锦衣卫暗中监视、设局加害。