2749年宇宙纪元，前联邦特种兵凌辰为救出被联邦囚禁意识的妹妹凌玥，与反叛组织黑客艾拉合作，潜入联邦天穹塔夺取可重构意识的星骸代码。此举遭野心勃勃的联邦议长维克多阻挠，他妄图借代码获永生统治星际。星骸族观察者泽拉为守护族群文明核心，暗中协助二人。最终凌辰、艾拉夺得代码唤醒凌玥，却被维克多污染代码。四人结成同盟，一边破解代码危机，一边抵御维克多与各方势力，星际命运对决拉开序幕。