2008年——因一股神秘的力量出现，日本的动画、游戏、漫画、音乐、铁道、cos等御宅文化被消灭。就这样，在维持秩序的「SSC」维护下，御宅文化几乎消失殆尽。为了夺回御宅文化，比任何人还深爱秋叶原以及御宅文化的「御宅英雄」，以及崇拜他的3名魔法少女「安那其」、「Blue」、「Pink」举起反旗。舞台为2011年的日本，秋叶原革命军与SSC首领「SHOBON」展开激战。